(抗擊新型肺炎)超算技術(shù)投入新型冠狀病毒基因組分析
中新網(wǎng)北京3月3日電 (記者 劉育英)英特爾、聯(lián)想以及華大基因3日宣布,三家公司正攜手加快COVID-19新型冠狀病毒的基因組特性分析。
在基因測序工作中,每毫升體液通常會包含數(shù)百萬個(gè)不同的病毒體,而每個(gè)病毒體的基因組則包含大約30,000個(gè)DNA堿基或字母。華大基因正在對許多感染患者和疑似感染患者的微生物進(jìn)行基因測序,因此這些研究工作將會生成TB級乃至PB級的海量數(shù)據(jù)。
要想高效地快速處理這些重要數(shù)據(jù),就需要采用更為先進(jìn)的高性能計(jì)算基礎(chǔ)架構(gòu)、計(jì)算技術(shù)以及優(yōu)化的基因組分析方法。
英特爾和聯(lián)想攜手為華大基因提供的技術(shù)包括一個(gè)大型高性能計(jì)算集群,可用于處理從華大DNBSEQ-T7測序系統(tǒng)讀取的高通量數(shù)據(jù)。華大基因的研究人員將能夠通過全新的高性能計(jì)算和基因組分析技術(shù),以及英特爾和聯(lián)想的相關(guān)資源和專業(yè)知識,進(jìn)一步加速他們對新型冠狀病毒的基因組特性研究。
該技術(shù)將支持科學(xué)家研究病毒的毒性、傳播模式、病原體與宿主間的相互作用,進(jìn)而助力流行病學(xué)及疫苗設(shè)計(jì)研究。這些工作對于未來創(chuàng)建更好的診斷方法和設(shè)計(jì)有效的疫苗或其他保護(hù)性措施(例如免疫療法)是非常必要的。
通過這項(xiàng)合作,華大基因?qū)⒌靡岳^續(xù)優(yōu)化其新型冠狀病毒檢測試劑盒并獲取大量有價(jià)值的信息。(完)